Право платить налоги как самозанятый (НПД) утрачивается сразу же - с того дня, когда появились основания, препятствующие его применению.
Следовательно, как только доходы превысили установленный лимит в 2,4 млн. руб., все последующие доходы самозанятого будут облагаться НДФЛ в общем порядке (п. 19 ст. 5 закона от 27.11.2018 № 422-ФЗ).
При этом все ранее полученные «самозанятые» доходы так и останутся учтенными в рамках этого спецрежима. Пересчитывать и доплачивать НДФЛ задним числом не нужно. На это указали налоговики в письме от 20.02.2019 № СД-4-3/2899@.
Кстати, если вы работаете с самозанятым лицом, то вам нужно держать его статус под контролем, чтобы вовремя начать удерживать НДФЛ и начислять страхвзносы (подробнее о налогообложении договоров с самозанятыми читайте в нашем материале). Для этого можно воспользоваться специальным сервисом на сайте ФНС. Просто введите в поисковых строках ИНН вашего контрагента и дату, на которую вы хотите проверить его статус. Сервис быстро сформирует ответ, является ли он самозанятым или нет.